Idag finns det 64 nationella kvalitetsregister på hälso- och sjukvårdsområdet. Fortfarande saknas många sådana register inom stora områden: psykiatri, primärvård, äldrevård, tandvård.

Sedan 2007 sköter Sveriges Kommuner och Landsting (SKL) all central administration av registren. Uppbyggnaden och hanteringen av registren i övrigt sker på olika ställen i landet. En registerhållare, oftast en läkare, har huvudansvaret för respektive register.

Staten, sjukvårdshuvudmännen och Socialstyrelsen har hittills stått för finansieringen. Varje register måste presentera en årsrapport och söka pengar på nytt varje år. En särskild beslutsgrupp med företrädare för SKL, Svenska Läkaresällskapet och Svensk Sjuksköterskeförening avgör hur pengarna ska fördelas. Till sin hjälp har de en expertgrupp.